论著
邢玉洁, 贾兆乾, 冯婷, 左红艳, 李杨
目的 探讨由C3H/HeN小鼠肺组织分离的Csf3rhiCD14hi中性粒细胞(Neu)照射前后转录组特征。方法 将12只C3H/HeN小鼠随机分为对照组和照射组,单次胸部照射,剂量为20 Gy。照射后24周,采用流式细胞术由肺组织细胞分选对照组和照射组Csf3rhiCD14hiNeu和Csf3rlowCD14hiNeu 2种Neu亚群。通过RNA测序技术对2类细胞进行转录组测序(RNA-Seq),使用DESeq2软件筛选差异表达基因,并结合基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库进行功能富集分析及基因集富集分析(GSEA)。结果 照射后24周,C3H/HeN小鼠肺泡腔面积显著减少,胶原沉积增加,出现局部纤维化。应用流式细胞术分选Csf3rhiCD14hiNeu与Csf3rlowCD14hiNeu,RNA-Seq结果表明,照射组Csf3rhiCD14hiNeu与Csf3rlowCD14hiNeu比较,存在1499个显著差异表达基因,其中179个上调,1320个下调;对照组Csf3rhiCD14hiNeu与Csf3rlowCD14hi Neu比较,显著上调基因701个,显著下调基因431个;照射组与对照组Csf3rlowCD14hi Neu比较,显著上调基因1319个,显著下调基因219个;照射组与对照组Csf3rhiCD14hiNeu比较,显著上调基因202个,显著下调基因540个。GO功能富集分析表明,这些差异表达基因参与免疫应答、Wnt信号通路及细胞因子生成。 KEGG分析提示,其在TGF-β信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用及Jak-STAT信号通路中显著富集。GSEA进一步显示,非经典NF-κB信号通路、PD-1信号转导及层粘连蛋白相互作用等相关通路存在显著差异。结论 γ射线胸部照射可导致 C3H/HeN 小鼠肺纤维化,其肺组织中 Csf3rhiCD14hiNeu 与 Csf3rlowCD14hiNeu 2种Neu亚群在照射前后存在显著转录组差异。